小麦发生茎基腐病，主要表现为茎基部褐变，发病后茎基部1～2个节间变为褐色，潮湿条件下茎节处可见红色霉层，严重时叶片枯死，并出现白穗，白穗植株籽粒秕瘦甚至无籽。一般来说，小麦茎基腐病病菌有两次侵染集中的时期，分别为冬前小麦苗期至分蘖期、春后返青拔节期。采取播前种子处理和返青期喷药相结合的方式，对小麦茎基腐病的防控效果较好。单一进行种子处理或返青期茎叶喷雾，并不能有效控制小麦茎基腐病的病情。
在小麦茎基腐病发病初期，选用丙硫菌唑·戊唑醇、戊唑·噻霉酮、丙硫菌唑等药喷雾，有一定的控病效果。另外，施用噁霉灵、苯醚甲环唑、噻呋酰胺等药，也能在一定程度上控制病情扩展。注意加足水量和药量对小麦茎基部发病部位粗喷雾，以提高防治效果。
